Lyrický román - největší dílo spisovatele - je psán v epistolární podobě. Jméno protagonisty - Hyperion - odkazuje na obraz titana, otce boha Slunce Heliosa, jehož mytologické jméno znamená High-Seating. Zdá se, že akce románu, který je jakýmsi „duchovním odyseaem“ hrdiny, se odehrává časem, i když arénou událostí je Řecko druhé poloviny 18. století, které je pod tureckým jhohem (o čemž svědčí odkazy na povstání v moři a bitva o Chesme v 1770).
Po soudních procesech, které padly na jeho pozemek, se Hyperion odchýlil od účasti v boji za nezávislost Řecka, ztratil naději na bezprostřední osvobození své vlasti, uvědomí si svou bezmocnost v moderním životě. Od této chvíle si pro sebe vybral cestu odloučení. Hyperion má příležitost vrátit se znovu do Řecka a usadil se na Korintském Isthmu, odkud píše dopisy svému příteli Bellarminovi, který žije v Německu.
Zdálo by se, že Hyperion dosáhl žádoucí, ale kontemplativní poustevna také nepřináší uspokojení, příroda mu už neotevře paži, vždycky dychtivý po sloučení s ní, najednou se cítí jako cizinec, jí nerozumí. Zdá se, že není předurčen k tomu, aby našel harmonii uvnitř sebe ani venku.
V reakci na Bellarminovy žádosti mu Hyperion píše o svém dětství stráveném na ostrově Tinos, o snech a nadějích té doby. Odhaluje vnitřní svět bohatě nadaného dospívajícího, neobvykle citlivého na krásu a poezii.
Obrovský vliv na utváření názorů mladého muže má jeho učitel Adamas. Hyperion žije ve dnech hořkého úpadku a národního zotročení své země. Adamas vštípí žákovi obdiv ke starověku, navštěvuje s ním nádherné ruiny bývalé slávy, mluví o odvaze a moudrosti jeho velkých předků. Hyperion zažívá těžký rozchod se svým milovaným mentorem.
Hyperion, plný duchovní síly a vysokých podnětů, odchází na Smyrnu, aby studoval vojenské záležitosti a navigaci. Je povznesený, touží po kráse a spravedlnosti, neustále se setkává s lidskou dvojitou tváří a zoufalství. Skutečným úspěchem je setkání s Alabandou, na kterém najde blízkého přítele. Mladí muži se baví v mládí, doufají v budoucnost, jsou spojeni s vysokou myšlenkou osvobození své vlasti, protože žijí ve vyhubené zemi a nemohou se s tím smířit. Jejich názory a zájmy jsou do značné míry blízké, nezamýšlejí se stát jako otroky, kteří se obvykle oddávají sladké fackě, jsou ohromeni žízní po činu. Zde se odhalí rozpor. Alabanda - muž praktických akcí a hrdinských impulzů - neustále sleduje myšlenku potřeby „vyhodit shnilé pařezy“. Hyperion však trvá na tom, že je třeba vzdělávat lidi ve znamení „teokracie krásy“. Alabanda takové argumenty nazývá prázdné fantazie, hádky přátel a část.
Hyperion zažívá další krizi, vrací se domů, ale svět kolem sebe je bělený, odjíždí do Calavria, kde ho komunikace s krásami středomořské přírody opět probudí k životu.
Notarův přítel ho přivede do stejného domu, kde potká svou lásku. Diomita se mu zdá božsky krásná, vidí v ní neobvykle harmonickou povahu. Láska spojuje jejich duše. Dívka je přesvědčena o vysoké volbě jejího vyvoleného - být „vychovatelkou lidí“ a vést boj vlastenců. Přesto Diomita je proti násilí, dokonce aby vytvořil svobodný stát. A Hyperion si užívá štěstí, které k němu přišlo, získalo klid mysli, ale očekává tragické rozuzlení idyly.
Od Alabandy obdrží dopis se zprávou o nadcházející řeči řeckých vlastenců. Poté, co se rozloučila se svým milencem, Hyperion spěchá, aby se připojila k řadám bojovníků za osvobození Řecka. Je plný naděje na vítězství, ale je poražen. Důvodem je nejen impotence před vojenskou silou Turků, ale také v rozporu s ostatními, střet ideálu s každodenní realitou: Hyperion cítí nemožnost výsadebního ráje pomocí skupiny lupičů - vojáci osvobozenecké armády provádějí loupeže a masakry a nic nemůže být omezeno.
Poté, co se rozhodl, že se svými krajany nemá nic společného, vstoupí Hyperion do služby v ruské flotile. Od nynějška na něj čeká osud vyhnanství, proklínal ho i jeho vlastní otec. Frustrovaný, morálně postižený, hledá smrt v Chesme námořní bitvě, ale zůstává naživu.
Poté, co rezignoval, má v úmyslu konečně klidně se uzdravit s Diomitou někde v Alpách nebo Pyrenejích, ale dostává zprávu o její smrti a zůstává nesnesitelným.
Po mnoha potulkách skončí Hyperion v Německu, kde nějakou dobu žije. Reakce a zaostalost, která tam panuje, se mu však zdají dusivá. V dopise kamarádovi sarkasticky hovoří o falešnosti umírajícího veřejného pořádku, o německém nedostatku občanských pocitů, malicherných tužeb, smíření se skutečností.
Jakmile učitel Adamas předpověděl Hyperionovi, že takové povahy, jako je on, jsou odsouzeny k osamělosti, putování a věčné nespokojenosti se sebou samými.
A Řecko je poraženo. Diomita je mrtvá. Hyperion žije v chatrči na ostrově Salamis, třídění vzpomínkami na minulost, truchlící po ztrátách, nepraktičnosti ideálů, snaží se překonat vnitřní nesouhlas a zažívá hořký pocit melancholie. Zdá se mu, že splatil černou nevděčnost své mateřské země, zanedbával jeho život a všechny dary lásky, které promrhala. Jeho osudem je rozjímání a filozofování, jako předtím zůstává věrný panteistické představě o vztahu člověka a přírody.